PHOTO-IDENTIFICATION: APHIS

APHIS

We have developed a new software, APHIS, for photo-matching that minimizes the pre-processing time and maximize the speed of the matching procedure. APHIS can process photos in batches of hundreds and users can select between two alternative matching procedures, one interactive (SMP), built as an extension of existing and freely available software, and one authomatic (ITM).
 

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user manual


4 comments:

  1. Hola, buenos días.
    He leido una parte del manual de vuestro programa APHIS y para el caso de lagartos usais fotos de las escamas ventrales. En cada imagen hay que marcar dos puntos, uno a la izquierda y otro a la derecha que se deben marcar igual en todas las fotos. Por lo tanto, supongo que no se pueden usar imágenes de lados izquierdos y derechos de una parte del cuerpo de cada ejemplar (los puntos de referencia tendrían situaciones opuestas). ¿Es así?
    Gracias
    Saludos
    Miguel Molina-Borja

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  2. Buenos dias,
    perdona pero no me habia enterado de tu comentario. No sé si he comprendido bien tu problema. Si te refieres en usar dos fotos o una foto lateral. En la procedura ITM se necesitan dos puntos, como tu dice. Es importante que los puntos sean siempre en el mismo sitio del animal. No es importante que parte del cuerpo usas, pero sí es importante que los puntos de referencia sean el el mismo sitios del cuerpo en cada foto. El programa "gira" los puntos para que sean alineados, "corta" un espacio arriba de los puntos y analiza las estadisticas de colores y contraste. Al momento usamos mas la procedura STP porqué permite usar fotos en condiciones de luz y contraste diferentes.
    Si tienes mas preguntas o quieres que hacemos una prueba con tu fotos, puedes contactarme directamente (g.tavecchia-at-uib.es)
    Un saludo
    Giacomo

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  3. Hola, les informo de esta publicación sobre el uso de APHIS en el contexto del monitoreo de un anfibio con patrones complejos de cromatoforos: Renet J, Leprêtre L, Champagnon J, Lambret P (2019) Monitoring amphibian species with complex chromatophore patterns: a non-invasive approach with an evaluation of software effectiveness and reliability. Herpetological journal 29:13–22. https://doi.org/10.33256/hj29.1.1322

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    Replies
    1. Hi Jocelyn,

      thank you for your post and the interesting reference. ITM procedure in APHIS has been made to minimize pre-processing time. It works well when images are standardized (same light, same intensity, contrast..etc..). like those you can have it in a lab. We have used a portable photo-box in the field, but I admit it is not very handy. ITM is suitable with highly contrasted patterns as those in the spectacled salamader. We are planning to develop an improved version of APHIS and your study will be very useful.

      Thank you again.
      Giacomo

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